MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS5

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016847	TTG	2	6	4	9	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016847	AATTTT	2	12	28	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016847	GTG	2	6	62	67	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016847	CAGGAT	2	12	148	159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378976154
5	NC_016847	T	6	6	159	164	0 %	100 %	0 %	0 %	378976154
6	NC_016847	CCA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378976154
7	NC_016847	TGT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976154
8	NC_016847	CAT	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976154
9	NC_016847	TAA	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976154
10	NC_016847	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976154
11	NC_016847	TAACT	2	10	484	493	40 %	40 %	0 %	20 %	378976154
12	NC_016847	ATC	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976154
13	NC_016847	GAC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976154
14	NC_016847	GAG	2	6	606	611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976155
15	NC_016847	CAT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976155
16	NC_016847	ATCAAG	2	12	671	682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378976155
17	NC_016847	CAG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976155
18	NC_016847	TGT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976156
19	NC_016847	CTCA	2	8	824	831	25 %	25 %	0 %	50 %	378976156
20	NC_016847	GCG	2	6	857	862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976156
21	NC_016847	GCAT	2	8	873	880	25 %	25 %	25 %	25 %	378976156
22	NC_016847	AGG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976156
23	NC_016847	A	7	7	916	922	100 %	0 %	0 %	0 %	378976156
24	NC_016847	C	6	6	961	966	0 %	0 %	0 %	100 %	378976156
25	NC_016847	GTG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976156
26	NC_016847	GGC	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976156
27	NC_016847	C	6	6	1190	1195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_016847	CTG	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016847	GCA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016847	GCAGA	2	10	1298	1307	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016847	ACC	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016847	GGT	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016847	TAC	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016847	CTC	2	6	1480	1485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016847	CAA	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976157
36	NC_016847	ATC	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976157
37	NC_016847	AAG	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976157
38	NC_016847	AAT	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976157
39	NC_016847	ATA	2	6	1781	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976157
40	NC_016847	TCA	2	6	2024	2029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
41	NC_016847	TCA	2	6	2069	2074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
42	NC_016847	A	6	6	2142	2147	100 %	0 %	0 %	0 %	378976158
43	NC_016847	T	7	7	2182	2188	0 %	100 %	0 %	0 %	378976158
44	NC_016847	AAG	2	6	2207	2212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976158
45	NC_016847	A	6	6	2237	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	378976158
46	NC_016847	TCA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
47	NC_016847	A	6	6	2345	2350	100 %	0 %	0 %	0 %	378976158
48	NC_016847	TTATA	2	10	2355	2364	40 %	60 %	0 %	0 %	378976158
49	NC_016847	TC	3	6	2397	2402	0 %	50 %	0 %	50 %	378976158
50	NC_016847	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378976158
51	NC_016847	AAAG	2	8	2440	2447	75 %	0 %	25 %	0 %	378976158
52	NC_016847	AGCA	2	8	2523	2530	50 %	0 %	25 %	25 %	378976158
53	NC_016847	CTT	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
54	NC_016847	CTT	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
55	NC_016847	T	6	6	2619	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	378976158
56	NC_016847	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
57	NC_016847	T	6	6	2668	2673	0 %	100 %	0 %	0 %	378976158
58	NC_016847	A	8	8	2744	2751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016847	CAA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016847	ACC	2	6	2852	2857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016847	GCAT	2	8	2896	2903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016847	GC	3	6	2910	2915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016847	TTC	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016847	TCC	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016847	TCG	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016847	CGGC	2	8	3085	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016847	GAC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016847	TGAAT	2	10	3153	3162	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016847	A	6	6	3180	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016847	TGA	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016847	TCA	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016847	ATA	2	6	3235	3240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016847	GTC	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016847	ATTT	2	8	3337	3344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.